Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms