Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDHAF4Q5VUM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF4Q5VUM1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms