Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH2Q5VUJ6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms