Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms