Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC38Q5VT99 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms