Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC18Q5T9S5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms