Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms