Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CATSPEREQ5SY80 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CATSPEREQ5SY80 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms