Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPANXN3Q5MJ09 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms