Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A13Q5J8X5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A13Q5J8X5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms