Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR4Q5GH76 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms