Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN4Q5BKX8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAVIN4Q5BKX8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAVIN4Q5BKX8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms