Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms