Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC44A4Q53GD3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms