Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCBP3Q53F19 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms