Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q4G0T1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q4G0T1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q4G0T1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q4G0T1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q4G0T1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q4G0T1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q4G0T1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q4G0T1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q4G0T1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q4G0T1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q4G0T1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q4G0T1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q4G0T1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q4G0T1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q4G0T1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q4G0T1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q4G0T1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q4G0T1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q4G0T1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q4G0T1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Q4G0T1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q4G0T1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q4G0T1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q4G0T1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q4G0T1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q4G0T1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q4G0T1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q4G0T1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q4G0T1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q4G0T1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q4G0T1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q4G0T1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q4G0T1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q4G0T1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q4G0T1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms