Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms