Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A52Q3SY17 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms