Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP41Q3LFD5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP41Q3LFD5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP41Q3LFD5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP41Q3LFD5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP41Q3LFD5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP41Q3LFD5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms