Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NBPF1Q3BBV0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NBPF1Q3BBV0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms