Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms