Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL40Q2TBA0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms