Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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