Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPROQ16827 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPROQ16827 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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