Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FSCN1Q16658 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms