Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX1AQ16623 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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