Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAPC1Q16533 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAPC1Q16533 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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