Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC1Q15915 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC1Q15915 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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