Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCN9AQ15858 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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