Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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