Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKIV2LQ15477 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIV2LQ15477 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms