Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A1Q15459 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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