Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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SEC23BQ15437 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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SEC23BQ15437 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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SEC23BQ15437 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEC23BQ15437 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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SEC23BQ15437 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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SEC23BQ15437 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SEC23BQ15437 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SEC23BQ15437 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SEC23BQ15437 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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SEC23BQ15437 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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SEC23BQ15437 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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