Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP1Q15431 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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