Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.072e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.082e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAZAP2-213ENST00000552173 539 ntTSL 45.01□□□□□ -1.612e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.72e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.92e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 ARID1A-208ENST00000532781 2583 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.063e-10■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 ARID1A-206ENST00000466382 2699 ntTSL 213□□□□□ -0.333e-10■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 ARID1A-217ENST00000637788 3046 nt10.24□□□□□ -0.773e-10■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 SLC25A39-217ENST00000593166 797 ntTSL 317.25■□□□□ 0.352e-9■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.599e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.569e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.559e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.489e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.379e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.455e-6■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.72e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-207ENST00000456097 1138 ntTSL 512.8□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-218ENST00000527659 2436 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.622e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.742e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-233ENST00000639623 3395 ntTSL 57.38□□□□□ -1.232e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.232e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.392e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.472e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 CLCN7-214ENST00000569851 1014 ntTSL 517.8■□□□□ 0.445e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.031e-6■■■■□ 24
PCBP1Q15365 TRIM28-213ENST00000598355 714 ntTSL 217.94■□□□□ 0.461e-10■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 513.21□□□□□ -0.34e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.354e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.44e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.54e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.574e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 24
PCBP1Q15365 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 24
PCBP1Q15365 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.966e-21■■■■□ 24
PCBP1Q15365 P4HB-202ENST00000415593 1669 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.536e-22■■■■□ 24
PCBP1Q15365 P4HB-220ENST00000575069 2453 ntTSL 216.11■□□□□ 0.176e-21■■■■□ 24
PCBP1Q15365 GRK2-207ENST00000529738 500 ntTSL 223.31■■□□□ 1.327e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 TOX3-205ENST00000568436 548 ntTSL 321.43■■□□□ 1.027e-11■■■■□ 24
PCBP1Q15365 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.017e-11■■■■□ 24
PCBP1Q15365 ARID1A-212ENST00000636219 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.9□□□□□ -0.664e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.296e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.246e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 228.66■■■□□ 2.186e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.16e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.966e-7■■■■□ 24
PCBP1Q15365 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.298e-9■■■■□ 24
PCBP1Q15365 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.443e-6■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.443e-6■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.243e-6■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.183e-6■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.943e-6■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.443e-6■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.042e-7■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.892e-7■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 SRRM2-213ENST00000573311 732 ntTSL 216.58■□□□□ 0.243e-21■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.741e-6■■■■□ 23.9
PCBP1Q15365 APEX2-201ENST00000374987 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.012e-9■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 PLOD3-212ENST00000478082 1585 ntTSL 220.59■□□□□ 0.894e-7■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.234e-7■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.394e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.654e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 220.84■□□□□ 0.931e-7■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 214.93□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.465e-26■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.357e-7■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 TRABD-206ENST00000472677 1661 ntTSL 1 (best)23.51■■□□□ 1.352e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.152e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 HDAC5-205ENST00000587135 504 ntTSL 221.64■■□□□ 1.056e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 TRABD-205ENST00000463233 2404 ntTSL 1 (best)21.16■□□□□ 0.982e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.82e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 HDAC5-209ENST00000588703 445 ntTSL 320.02■□□□□ 0.86e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.26e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.156e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-15■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SPTBN1-205ENST00000496323 2225 ntTSL 214.62□□□□□ -0.072e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.176e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-218ENST00000475913 534 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.196e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-210ENST00000469095 1736 ntTSL 513.15□□□□□ -0.36e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 LINC00852-201ENST00000475197 1328 ntBASIC12.88□□□□□ -0.352e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-208ENST00000468168 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.376e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-232ENST00000491341 1141 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.386e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SERPINA3-208ENST00000556968 1289 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.441e-15■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-233ENST00000491482 431 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.456e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SERPINA3-202ENST00000393080 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-15■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-219ENST00000476738 838 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.486e-6■■■■□ 23.8
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