Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NECTIN1Q15223 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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