Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC3Q15034 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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