Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.264e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RFXANK-209ENST00000540981 832 ntTSL 516.58■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RNF31-209ENST00000559071 1943 ntTSL 216.43■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ECH1-211ENST00000598707 882 ntTSL 216.26■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 B4GALNT1-216ENST00000553142 5580 ntTSL 216.17■□□□□ 0.184e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.184e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ECH1-203ENST00000594391 919 ntTSL 516.1■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.164e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB6-208ENST00000441561 1022 ntTSL 515.55■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 GBGT1-205ENST00000470431 2870 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.054e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 04e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.034e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.044e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.074e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 GBGT1-206ENST00000472281 2948 ntTSL 214.53□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 TMEM208-211ENST00000566486 796 ntTSL 314.48□□□□□ -0.094e-9■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 TMEM208-208ENST00000564087 518 ntTSL 514.48□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ECH1-215ENST00000601333 710 ntTSL 214.4□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.124e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ACADVL-224ENST00000580365 494 ntTSL 214.26□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PIK3R2-203ENST00000459743 465 ntTSL 214.02□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ECH1-216ENST00000601778 799 ntTSL 513.91□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CAPN1-219ENST00000530495 572 ntTSL 513.83□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 SEC13-206ENST00000397102 582 ntTSL 313.76□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ACER3-201ENST00000278544 3500 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.244e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 SEC13-205ENST00000397101 592 ntTSL 213.31□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-219ENST00000552202 1290 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 SEC13-204ENST00000397099 555 ntTSL 413.12□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.344e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 SEC13-211ENST00000431352 832 ntTSL 512.89□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PIK3R2-204ENST00000464016 588 ntTSL 312.7□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RNF31-223ENST00000560754 606 ntTSL 312.68□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-218ENST00000551723 415 ntTSL 512.43□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.434e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CEPT1-209ENST00000498239 1957 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CEPT1-201ENST00000357172 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB6-214ENST00000486083 699 ntTSL 512.02□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 NCOR1-224ENST00000583234 755 ntTSL 312□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB14-212ENST00000610281 339 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 AL136295.5-201ENST00000558468 4798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.514e-8■■■■■ 42.6
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EFTUD2Q15029 CEPT1-210ENST00000545121 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.594e-8■■■■■ 42.6
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EFTUD2Q15029 PPHLN1-224ENST00000613154 1863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.754e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RFXANK-211ENST00000543118 422 ntTSL 210.14□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 NCOR1-210ENST00000458113 3490 ntTSL 29.84□□□□□ -0.834e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-203ENST00000337898 1465 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.844e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.974e-8■■■■■ 42.6
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EFTUD2Q15029 RAF1-208ENST00000471449 804 ntTSL 28.88□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 NCOR1-203ENST00000395849 3419 ntTSL 28.86□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB6-217ENST00000488001 551 ntTSL 48.65□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 NCOR1-214ENST00000470782 3987 ntTSL 1 (best)8.24□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 28.24□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 42.6
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EFTUD2Q15029 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB14-209ENST00000471738 561 ntTSL 27.67□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-207ENST00000463907 1623 ntTSL 27.64□□□□□ -1.194e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 NCOR1-212ENST00000464381 2474 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.224e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.244e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 B4GALNT1-207ENST00000549391 879 ntTSL 37.19□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 NCOR1-219ENST00000580554 650 ntTSL 26.98□□□□□ -1.294e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.34e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.314e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.364e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.374e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CEPT1-206ENST00000478042 2175 ntTSL 56.21□□□□□ -1.424e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 EIF4A2-225ENST00000496382 460 ntTSL 1 (best)6.17□□□□□ -1.424e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 EIF4A2-226ENST00000497177 849 ntTSL 55.71□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-209ENST00000469622 556 ntTSL 45.63□□□□□ -1.514e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-206ENST00000463364 1625 ntTSL 1 (best)5.51□□□□□ -1.534e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ACER3-208ENST00000530334 931 ntTSL 25.4□□□□□ -1.544e-8■■■■■ 42.6
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