Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBR1Q14596 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBR1Q14596 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NBR1Q14596 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBR1Q14596 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBR1Q14596 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBR1Q14596 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBR1Q14596 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBR1Q14596 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms