Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF235Q14590 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF235Q14590 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms