Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN5AQ14524 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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