Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BECN1Q14457 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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