Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1CQ14123 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms