Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP5Q14008 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP5Q14008 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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