Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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