Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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