Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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DNASE1L3Q13609 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNASE1L3Q13609 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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