Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B2Q13367 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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