Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF1Q13291 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF1Q13291 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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