Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC10A2Q12908 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC10A2Q12908 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms